El Centro de Investigación Pediátrica (Ciped) fue fundado el 10 de octubre de 1997 por el entonces rector, Prof. Dr. José Martins Filho. Inmediatamente después de la entrega de las instalaciones físicas en abril de 1998, sus investigadores presentaron proyectos de infraestructura a la FAPESP, los cuales fueron aprobados. Desde entonces, se han implementado progresivamente varios laboratorios.
Hoy en día, Ciped destina 09 laboratorios y realiza investigaciones colaborativas con la hospital de clinicas, CAISMO, centro de sangre, gastrocentro, CBMEG, Hospital de Maternidad de Campinas, Instituto Butantan, Universidade De São Paulo, Universidad Federal de Sao Paulo, Universidad de Toyama, Japón, Universidad de Massachusetts, Universidad de Chiba, Japón e Universidad McGill.
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